2012/8/21 Illumina社からTruSeq ChIP Sample Prep Kitが発売されました。 multiplex paired-end sequenceができるChIP-seqキットになったようです。PCRサイクルは18のままと感度の向上はさして無い模様です。 我々の方法だと4-6サイクルくらいのPCR増幅と非常に感度はよいです。使っているアダプターもTruSeqなので、新しく導入するならどうぞ私の方法をお使いください。
限られた予算・貴重なDryの解析を最大限活かすためには、やはりWet側のライブラリ作製での頑張りが重要なのではないかと思います。ライブラリ作製での情報の歪みの解消につながれば作った側としても嬉しいです。
